En 1976, Leothy Miller Owens era una joven educadora cuando comenzó Nkiru en su casa. En ese momento, Brooklyn tenía varias librerías afroamericanas, incluida la Librería afroamericana de Richardson, Freedom Bookstore, y Akiba Mkuu, fundada por la organización nacionalista negra The East. En un corto período de tiempo, la tienda se expandió a su propio espacio en 76 St. Marks Place. La Sra. Miller Owens murió en 1992. Su madre, Adelaide Miller, dirigió la tienda desde 1992 hasta 1999, cuando la tienda sufrió graves problemas financieros.
A principios de la década de 1990, cuando era adolescente, Talib Kweli trabajaba en una librería local diferente en Brooklyn que vendía libros convencionales. Mientras estuvo allí, se preocupó por la ausencia de literatura para los afroamericanos, y buscó trabajar en Nkiru. Inicialmente, no hubo puestos disponibles; sin embargo, Kweli hizo una presentación sólida para un trabajo, y pronto se le ofreció un puesto a tiempo parcial. Al familiarizarse íntimamente con la tienda, Kweli decidió que si alguna vez tuviera dinero, Nkiru estaría donde lo invirtió.